Intestins et estomac
Le tube digestif s'étend de la bouche à l'anus. Les aliments passent dans la bouche, l'œsophage, l'estomac puis les intestins pour être digérés. La flore intestinale, qui abrite quelque 100.000 milliards de bactéries, facilite la digestion. Elle est de plus en plus étudiée dans les MICI, dont fait partie la maladie de Crohn. Le reflux gastro-oesophagien s'explique par la remontée de liquide gastrique acide dans l'œsophage, ce qui cause des brûlures et des douleurs au niveau de la paroi, la muqueuse de l'oesophage. L'intestin peut être le siège d'une diverticulose, avec le développement de diverticules. Lorsque la paroi abdominale, composée de muscles, présente une zone de faiblesse, une hernie abdominale peut se développer.